U proces proizvodnje organskog gnojiva, izgradnja ventilacijskog sustava je vrlo važna. Kontrolom brzine ventilacije, temperatura sustava se može podesiti, može se osigurati pogodna okolina za rast i metabolizam mikroorganizama. Stoga, ventilacija u kompostiranju je neophodna. Tijekom kompostiranja, ventilacija ima tri glavne svrhe: opskrba kisikom, odvlaživanje i hlađenje.

  1. Potreba za kisikom: proces kompostiranja je završen osiguravanjem kisika za rast, razmnožavanje i metaboličke aktivnosti aerobnih mikroorganizama.
  2. Zahtjev za odvlaživanjem: ventilacija može ukloniti vlagu iz mokrih sirovina na višoj temperaturi. Kada se zrak zagrijava supstratom za kompostiranje, vlaga se može ispariti i kompostni materijali se mogu osušiti.
  3. Zahtjev za hlađenjem: ventilacija može ukloniti toplinu generiranu razgradnjom organske tvari za kontrolu temperature procesa.

Stopa ventilacije za opskrbu kisikom uglavnom ovisi o sadržaju organske tvari u sirovinama za kompostiranje, udio razgradivih komponenti u organskoj tvari i koeficijent razgradljivosti, što se može izračunati prema kemijskom sastavu i stupnju razgradnje organske tvari u kompostu.